Die Kirche des Heiligen Nikolaus vom Hospital wurde zwischen 1280 und 1289 erbaut, ein Datum, das durch die romanischen Merkmale ihrer Hauptfassade nahegelegt wird. Das einzige originale Element, das unversehrt überdauert hat, ist der kleine Glockenhelm, während der Bereich um das Portal im Laufe der Jahrhunderte erheblich verändert wurde.

Neben ihrer Funktion als Gotteshaus beherbergte die Kirche auch ein geheimes Kloster für Benediktinerinnen.

Heute zeigt das heilige Gebäude einen rechteckigen Grundriss mit einem einzigen Schiff, das leicht unterhalb des Niveaus des Innenhofs liegt. Ursprünglich war es vollständig mit Fresken dekoriert, wie ein erhaltenes Fragment links vom Eingang bezeugt: die Virgo Lactans, ein Gemälde aus dem 14. Jahrhundert, das die Jungfrau Maria darstellt, die das Christuskind stillt. Dieses Fresko zeichnet sich durch bemerkenswerte Wärme und Ausdruckskraft aus und fängt einen Übergangsmoment zwischen der starren Hieratik der byzantinischen Tradition und der aufkommenden Suche nach Volumen und Realismus in der mittelalterlichen Kunst ein. Der Kopf der Jungfrau ist sanft geneigt, ihre Stirn ist deutlich markiert – ein häufiges Merkmal der mittelalterlichen Malerei. Doch der zärtliche Blick, den sie ihrem Kind zuwendet, und der fließende Stoff legen einen klaren Versuch nahe, Dimensionalität und emotionale Tiefe zu vermitteln. Das Christuskind, im Profil dargestellt, scheint sich natürlich zu bewegen, was auf spätere künstlerische Tendenzen zur dynamischen Darstellung des menschlichen Körpers hinweist.

Unter dem Fresko befindet sich eine Nische, deren innere Wände noch Spuren zusätzlicher gemalter Dekorationen aufweisen, die jedoch durch spätere Baumaßnahmen teilweise verdeckt wurden.

Wenn man entlang des Schiffs in Richtung des Presbyteriums geht, stößt man auf eine kleine Eisengittertür. Einige Forscher glauben, dass dieses Merkmal aus der Zeit stammt, als das Gebäude ein geheimes Kloster beherbergte, sodass die Nonnen die Liturgie beobachten konnten, ohne gesehen zu werden. Andere vermuten, dass es sich um ein wiederverwendetes architektonisches Element handelt – möglicherweise Teil eines mittelalterlichen Begräbniskanals aus einer Zeit, als der Komplex unter der Obhut der Ritter des Johanniterordens stand.

Auf der rechten Seite, in der Nähe des Zentrums des Schiffs, wurden mehrere Begräbnisnischen freigelegt – jahrhundertelang verborgen, wahrscheinlich während der Renovierungen des 18. Jahrhunderts versiegelt.